菏泽高新区地处菏泽市区西部，辖万福办事处、吕陵镇、马岭岗镇，面积236平方公里、人口24.8万。2008年1月被省政府列为省级高新技术产业开发区，2013年10月理顺管理体制，是国家火炬生物医药特色产业基地、国家生物医药大健康创新型产业集群试点、国家级知识产权集群化管理试点区、国家海智工作基地、山东省第一批生物高技术产业基地、省级可持续发展实验区、省级小微企业创业创新示范基地、山东省创新药物（菏泽）孵化基地、省级战略性新兴产业（生物医药）示范基地、省级食品生产加工示范基地等。2017年，全区实现地区生产总值121.8亿元，增长9.5%；完成公共财政预算收入12.1亿元，增长5.9%；规模以上工业企业实现主营业务收入427.5亿元，增长11.7%；实现利润69亿元，增长8%；完成固定资产投资53.5亿元，增长16.3%。